השירות לאנדוקרינולוגיה בילדים מאבחן ומטפל בפעוטות ובילדים עד גיל 18 (במחלות כרוניות המעקב נמשך גם עד גיל 20).

פעילות קלינית:
המרפאה עוסקת בברור מגוון בעיות הורמונליות בילדים ביניהן: בעיות גדילה, בעיות בבלוטת התריס, בעיות בהתפתחות מינית, בעיות השמנה.

הצוות כולל את מנהלת המרפאה - מומחית לאנדוקרינולוגיה בילדים ואחות שהוכשרה לביצוע מבחנים אנדוקריניים, כולל טסט למלאי הורמון גדילה על סוגיו השונים, טסטים להערכת מצב ההתבגרות המינית, טסט להערכת תפקוד בלוטה יתרת המוח ויותרת הכליה, ויצור הורמונים בבלוטת יותרת הכליה.

השירות פועל בעזרת גישה אבחנתית וטיפולית מעודכנת המקובלת בעולם, על מנת להגיע לאבחון ולטיפול מוקדמים לשם הבטחת איכות חיים וגדילה תקינים.
כאשר נדרשת הרחבת הבירור, מתאשפזים הילדים במחלקת ילדים. הטסטים להערכת הפעילות של המערכת האנדוקרינית מתבצעים במרפאות חוץ ילדים

פעילות המרפאה בתחום הגדילה כוללת :
 מעקב אחר צמיחה לגובה של ילדים עם חריגות בגובה (קומה נמוכה או קומה גבוהה).
 מעקב אחר ילדים עם מחלות כרוניות העלולות לפגוע בצמיחה לגובה.
 ביצוע מעקב אחר תינוקות עם פיגור גדילה תוך רחמי ומשקל לידה נמוך.
 ביצוע טסטים להערכת מלאי הורמון הגדילה.
 מתן טיפול בהורמון גדילה בהתאם לאבחנה וביצוע מעקב אחר תוצאות הטיפול.

מרפאה ייחודית של מעקב אחרי ילדים שהחלימו ממחלות ממאירות:
בעשורים האחרונים נצפתה עליה ניכרת באחוזי ההחלמה ממחלות ממאירות בילדים.
מחקרים רבים מראים כי לחלק מהטיפולים (קרינה וכימותרפיה, השתלת מוח עצם) יש השלכות ארוכות טווח על הגדילה, על ההתבגרות, על פעילות של בלוטת התריס, על בריאות עצם, על מצב הפוריות ועל תפקודים הורמונליים אחרים.
מטרת הפעילות במרפאה הנה איתור מוקדם של הסיבוכים הללו ומתן טיפול בהתאם.

פעילות המרפאה בתחום בלוטת התריס:
 מעקב אחר ילודים שבתוצאות הסקר הארצי לאחר הלידה נמצאה אצלם הפרעה בתפקודי בלוטת 
  התריס.
 מעקב וטיפול בילדים ובני נוער עם יתר או תת פעילות הבלוטה.

פעילות המרפאה בתחום התפתחות מינית:
מעקב וטיפול בילדים עם התפתחות מינית מוקדמת, התפתחות מינית מאוחרת.

פעילות המרפאה בתחום אי סדירות מחזורים/ שיעור יתר:
בירור לאיתור גורמים הורמונליים וטיפול בהתאם.

פעילות המרפאה בתחום בעיות במשק העצם:
אבחון וטיפול בהפרעות ברמות הסידן והזרחן, חסר ויטמין D, הפרעה בבלוטת הפרה-תירואיד, רככת, שברים חוזרים (בעיקר שברים בעקבות טראומה קלה שלא מסבירה את חומרת השבר) ובעיה בריפוי שברים.
הדגש הוא על ילדים בסיכון לבעיה בבריאות עצם בשל מחלה כרונית (כגון מחלות נוירולוגיות, מחלות מעי דלקתיות המפריעות לספיגה וכו') או טיפול תרופתי הפוגע בעצם (כגון טיפול ממושך בסטרואידים, מטוטרקסט).

פעילות המרפאה בתחום השמנת יתר:
בבירור הורמונלי העלול לגרום להשמנת יתר ואיתור סיבוכים העלולים להיגרם מהשמנת יתר.
צוות המרפאה כולל גם דיאטנית.