מיקרוביולוגיה קלינית
המעבדה המיקרוביולוגית נותנת שירותי אבחנה של פתוגנים שונים כגון: חיידקים, וירוסים, פטריות ופרזיטים, למטופלי מרכז רפואי בני ציון ולגורמים חיצוניים. האבחנה במעבדה מתבצעת בשיטות מגוונות הכוללות בידוד החיידק בתרבית ושיטות סרולוגיות ומולקולאריות כגון:
Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) ELISA, (Polymerase Chain Reaction) PCR). המעבדה עובדת בכל ימות השבוע בשתי משמרות. הבדיקות מתקבלות מהשעה 08:00 בבוקר ועד ל- 22:30 בערב. למקרים דחופים ישנו כונן לאחר שעות העבודה.

המעבדה כוללת יחידות שונות מתחומי המיקרוביולוגיה הקלינית:
מעבדה בקטריולוגית הכוללת מס' תחומים: זיהומים במחזור הדם, זיהומים בנוזלי גוף, זיהומים לאחר ניתוח, זיהומים במע' הנשימה, זיהומים במע' האורוגנטלית, זיהומים במע' אף אוזן גרון, זיהומי עיניים ואיתור חיידקים הגורמים לשחפת. האבחון הבקטריולוגי מטרתו לבודד חיידקים רגילים ומפונקים מדגימות של חולים ולקבוע את רגישותם לאנטיביוטיקה.
מעבדה לביולוגיה מולקולארית המבצעת אבחון מהיר של זיהומים חיידקים באמצעות DNA חיידקי ב- PCR ו- Real Time - PCR.
מעבדה סרולוגית המאבחנת מחוללים נגיפיים וחיידקים ע"י בדיקת נוגדנים הנוצרים בגוף עקב מחלות זיהומיות שונות.
מעבדה לבדיקות שחפת ומיקובקטריות אחרות שבה מתבצעת צביעת Ziehl Neelsen וזיהוי ובידוד תרביות שחפת באמצעות GeneProbe ו- MGIT.
מעבדה לפטריות שתפקידה זיהוי ובידוד של פטריות ושמרים מדגימות קליניות כגון: נוזלי גוף, רקמות, פצעים, עור, שיער, ציפורניים וכו'.
מעבדה פרזיטולוגית המאבחנת פרזיטים שונים בשיטות מיקרוסקופיות ובשיטות מהירות לחיפוש אנטיגנים פרזיטריים.

מרפאת STD - אבחון וטיפול במחלות המועברות במגע מיני:
המרפאה לאבחון מחלות המועברות במגע מיני Sexually Transmitted Diseases) STD) היא הראשונה מסוגה בארץ. בשיתוף אורולוגים וגניקולוגים נבנה דגם ייחודי ארצי שבו נבדקים חולים חשודים במחלות מין בעזרת שיטות מעבדה רגישות ייחודיות שלא מקובלות ברוב המעבדות בארץ וניתן טיפול בהתאם לממצאים.

מרכז ארצי לאבחון שעלת:
למרות החיסון הקיים, מחלה זו עדיין שכיחה בקרב תינוקות קטנים ומבוגרים. עד כה הניטור של המחלה נעשה על פי דיווחים קליניים בלבד, וזאת בגלל שיטות מעבדתיות לא מדויקות שהיו קיימות עד כה. בשנתיים האחרונות הפעלנו פרוטוקול קליני לניטור המחלה בקרב ילדים ומבוגרים החשודים לשעלת וכן פיתחנו שיטה חדשה ורגישה המאפשרת אבחנה מהירה גם אם החולה תחת טיפול אנטיביוטי.